아카시아 망기움 목재 종 식별을 위한 단일염기다형성 마커 개발

안지영*, 김서현, 박주연

(국립산림과학원 산림생명정보연구과)

Development of single nucleotide polymorphism marker for identification of Acacia mangium wood species

Ji-Young Ahn*, Seohyun Kim, Ju-Yeon Park

(Division of Forest Bioinformation, National Institute of Forest Science)

요약: 아카시아 목재는 주로 장식장, 가구재, 바닥재 용도로 사용된다. 우리나라에는 원목 또는 제재목으로 수입되고 있다. 수입신고 서류에 따르면, 아카시아 목재는 베트남에서 가장 많이 수입되며 주로 아카시아 망기움(Acacia mangium) 종으로 알려져 있다. 아카시아 목재는 다른 수입 목재인 알비지아 목재와 마호가니 목재와 비교했을 때, 재색특성과 현미경 식별 특성이 유사하다. 따라서 해부학 식별 방법으로 정확하게 식별이 어려운 문제가 있다. 본 연구에서는 아카시아 목재로 알려진 아카시아 망기움 종을 식별하는 DNA 마커를 개발하고자 연구를 수행하였다. 아카시아 망기움 종을 포함하여 아카시아 속 종들의 엽록체 유전자 정보를 탐색한 결과, 6개 엽록체 유전자(matK, rbcL, psbA-trnH, trnL-trnF, trnK, trnF-matK) 내에서 총 111개의 단일염기다형성(SNP) 부위를 후보 DNA 마커 영역으로 선발하였다. 이 중 trnK 엽록체 유전자 정보를 이용하여 다른 아카시아속 종과 아카시아 망기움 종을 식별하는 신규 단일염기다형성 마커를 개발하였다. 개체 간  변이검증을  위해 아카시아 망기움 목재 시료 5개체를 확보하여 종 식별을 분석을 수행한 결과, 개발된 단일염기다형성 마커가 개체 변이 없이 아카시아 망기움 종 식별 마커로 활용될 수 있는 것으로 판단되었다.

Abstract: Acacia wood is mainly for decorative sanders, furniture, and flooring. It is imported into Korea as log and sawnwood. Acacia is the most import wood from Vietnam based on an import declaration document analysis. It is known as Acacia mangium among Acacia species. Acacia wood is undistinguishable other imported wood such as Albizia and Mahogany by using wood anatomy. Because color and microscopic identification characteristic is similar. We conducted study to develop single nucleo polymorphic DNA marker for Acacia mangium species identification based on Chloroplast DNA. We found chloroplast genes of Acacia genus species including Acacia mangium from Open NCBI data. Total of 111 single nucelotide polymorphism (SNP) region found  that candidate DNA markers based on six chloroplast genes (matK, rbcL, psbA-trnH, trnL-trnF, trnK, and trnF-matK) from NCBI open data. A single nucelotide marker developed within trnK, which could  identified between Acacia mangium and other Acacia species. Five Acacia mangium wood spmples were used for verification of inter-individual variation within trnK markers. It determined that the developing single nucleotide marker could be used for species identificaiton Acacia Mangium species without individual variation.

Keywords: Wood DNA, Species identification, DNA marker, DNA barcoding

사사: 본 연구는 산림청 국립산림과학원 연구개발과제인 ‘산림생명자원 유전정보 구축 및 바이오 지문 분석기술 개발 (Ⅱ) [FG0603-2025-01]’의 지원에 의해 이루어진 것임.