정금나무 미토콘드리아의 완전체 게놈 해독

이다현1,2, 심우현1*, 박충열3, 김도현2, 김준혁2, 김현민2,
제상훈2, 문성진1, 최한석1, 박완근1, 나채선2, 심상래1

(1강원대학교 산림과학부, 2국립백두대간수목원, 3국립원예특작과학원)

The complete mitochondrial genome of Vaccinium oldhamii Miq.

Da Hyun Lee1,2, Woohyun Sim1*, Chung Youl Park3, DoHyunKim2, JunHyeokKim2, HyeonMinKim2, SangHoonChe2, WangeunPark1, Chae Sun Na2 and Sangrea Shim1

(1Department of Forest Resources, College of Forest and Environmental Sciences,
Kangwon National University,

2Forest Bioresource Deparment, Baekdudaegan National Arboretum,

3National Institute of Horticultural and Herbal Science, Rural Development Administration)

요약: 정금나무(Vaccinium oldhamii Miq.)는 진달래목, 진달래과에 속하는 낙엽성 관목으로, 한국, 중국, 일본 등 북아시아에 자생한다. 이 나무의 열매는 식용 가능하며 높은 폴리페놀 함량과 항산화 성분을 지녀 경제적 가치가 크다. 또한, 정금나무 열매는 당뇨병, 비만, 심혈관 질환, 신경퇴행성 질환, 동맥경화증, 류마티스 관절염, 암 등의 질환에 효능이 있는 것으로 밝혀졌다. 본 연구에서는 정금나무의 미토콘드리아 게놈 서열을 조립하여, 626,941 bp의 원형 뉴클레오타이드 서열과 45.34%의 GC 함량을 가진 완전한 게놈 서열을 완성하였다. 정금나무의 미토콘드리아 게놈은 35개의 단백질 암호화 유전자, 24개의 tRNA 유전자, 3개의 rRNA 유전자로 구성되어 있다. 분자 계통학적 분석 결과, 정금나무는 V. macrocarpon과 가장 근연관계에 있는 것으로 나타났다.

Abstract: Vaccinium oldhamii Miq. is a a deciduous shrub in the Ericales and the Ericaceae and is native to Northeast Asia including Korea, China, and Japan. V. oldhamii has garnered particular interest due to the high economic value of its edible berries for human diet. The fruits are rich in polyphenols, known for antioxidant activity. These antioxidants are effective in managing a range of health issues, including diabetes, obesity, cardiovascular and neurodegenerative diseases, atherosclerosis, rheumatoid arthritis, and cancer. In this study, the complete mitochondrial genome sequence of V. oldhamii was assembled into 626,941bp circular nucleotides with a GC content of 45.34%. The mitochondrial genome of V. oldhamii comprises 35 known protein-coding genes, 24 tRNA genes, and 3 rRNA genes. Phylogenetic analysis showed that this species is closely related to the V. macrocarpon.

사사: 본 연구는 국립백두대간수목원 연구사업(0000-0002-2439-0803)과 정부(과학기술정보통신부)의 재원으로 한국연구재단의 지원을 받아 수행된 연구임(RS-2024-00343723).